| Микроорганизм | Препараты выбора | Препараты резерва |
| PRSA (пенициллинорезистентный S.aureus) | Оксациллин Цефалоспорины I поколения | Макролиды Линкозамиды Амоксициллин/клавуланат Ампициллин/сульбактам Ко-тримоксазол Ванкомицин |
| MRSA (метициллинорезистентный S. aureus) | Ванкомицин | Линезолид Тейкопланин Фузидиевая кислота Рифампицин Ципрофлоксацин Ко-тримоксазол |
| Бета-гемолитический стрептококк гр. А (S.pyogenes) | Феноксиметилпенициллин Пенициллин Беизатин бензилпенициллин (профилактика) | Цефалоспорины I поколения Макролиды Линкозамиды |
| Пневмококк пенициллиночувствительный | Пенициллин Ампициллин Амоксициллин Цефотаксим Цефтриаксон | Макролиды Цефалоспорины II поколения Цефепим Тетрациклины Левофлоксацин Моксифлоксацин Хлорамфеникол (при инфекциях ЦНС) |
| Пневмококк пенициллинорезистентный | Цефотаксим + ванкомицин Цефтриаксон + ванкомицин | Ванкомицин ± рифампицин Цефепим ± рифампицин Левофлоксацин Моксифлоксацин Имипенем Линезолид |
| Энтерококк | Пенициллин (или ампициллин) + гентамицин (или стрептомицин) | Гликопептиды + гентамицин (или стрептомицин) Линезолид |
| Менингококк | Пенициллин | Цефтриаксон Цефотаксим Хлорамфеникол Рифампицин (санация носителей) Ципрофлоксацин (санация носителей) |
| Гонококк | Цефтриаксон Цефотаксим | Ципрофлоксацин Офлоксацин Спектиномицин |
| Гемофильная палочка (Haemophilus influenzae) | Амлициллин Амоксициллин Цефалоспорины II-IV поколения | Ампициллин/сульбактам Амоксициллин/клавуланат Азитромимин Кларитромицин Фторхинолоны Хлорамфеникол Карбапенемы |
| Моракселла (Moraxella catarrhalis) | Амоксициллин-клавуланат Ампициллин/сульбактам Цефалоспорины II-III поколения | Ко-тримоксазол Азитромицин Кпаритромицин |
| Кишечная палочка (E. coli) — внебольничные инфекции | Ампициллин Амоксициллин Цефалоспорины II поколения | Амоксициллин/клавуланат Ампициллин/сульбактам Аминогликозиды II поколения Фторхинолоны Цефалоспорины III поколения |
| Семейство Enterobacteriaceae — Е. coli — Proteus spp. — Klebsiella spp. — Enterobacter spp. — Serratia spp. — Providentia и др. — нозокомиальные инфекции | Цефалоспорины III поколения + аминогликозиды II-III поколения | Карбапенемы + аминогликозиды II-III поколения Фторхинолоны Пиперациллин/тазобактам (или тикарциллин/клавуланат) + аминогликозиды II-III поколения Цефоперазон/сульбактам Цефепим ± аминогликозиды II-III поколения |
| Синегнойная палочка (Pseudomonas aeruginosa) | Цефтазидим (или цефоперазон) ± аминогликозиды II-III поколения Ципрофлоксаиин ± аминогликозиды II-III поколения | Цефепим ± аминогликозиды II-III поколения Карбапенемы + аминогликозиды II-III поколения Азтреонам ± аминогликозиды II-III поколения Полимиксины |
| Ацинетобактер | Ципрофлоксацин ± амикацин Карбапенемы ± амикацин | Ампициллин/сульбактам Цефоперазон/сульбактам Полимиксины |
| Шигеллы | Фгорхинолоны | Цефалоспорины III поколения Ко-тримоксазол Ампициллин |
| Сальмонеллы | Фторхинолоны Цефтриаксон | Ко-тримоксазол Ампициллин Хлорамфеникол |
| Легионелла | Эритромицин + рифампицин | Азитромицин ± рифампицин Кларитромицин Рифампицин Ципрофлоксаиин Доксициклин ± рифампицин |
| Анаэробные стрептококки | Пенициллин | Линкозамиды Амоксициллин/клавупанат Ампициллин/сульбактам Тетрациклины Хлорамфеникол |
| Фузобактерии | Пенициллин | Метронидазол Амоксициллин/клавуланат Ампициллин/сульбактам Линкозамиды Хлорамфеникол |
| Бактероиды (Bacteroides fragilis) | Метронидазол | Ингибиторозащищенные пенициллины Цефоперазон/сульбактам Карбапенемы Линкозамиды Хлорамфеникол |
| Листерии | Ампицилпин | Ко-тримоксазол Пенициллин (высокие дозы) |
| Хпамидии | Доксициклин Макролиды | Офлоксацин Левофлоксацин |
| Микоплазмы | Макролиды | Доксициклин Левофлоксацин |
| Трихомонады | Метронидазол | Тинидазол Орнидазол |
| Лямблии | Метронидазол Тинидазол | Фуразолидон |